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  1. Introduction
  2. Services de MBB
    • WWW
    • SSH cluster
    • Rstudio
    • Big Mem
    • GPU
    • Galaxy
  3. Architecture
  4. Services développement logiciel
    • Référencement
    • Intégration à MBB
    • Aide au développement logiciel
    • Formation

  MBB  

  • Initiative de l'ISEM (N. Galtier)
  • Missions :
    • Visibilité de l'activité développement logiciel de la communauté
    • Mutualisation des ressources pour le calcul
  • Labos associés : CEFE , CBGP, AMAP, MIVEGEC


Logo CeMEB
MBB Team
  • Khalid Belkhir
  • Rémy Dernat
  • Julien Veyssier
impress.js
Services de MBB
Services de MBB
Service WWW de MBB
WWW MBB
Service WWW de MBB
  • Description
    • Un service d'hébergement de logiciels (source ou binaire) ou de bases de données
    • Online Tools : exécuter directement un programme depuis le navigateur
    • Des ressources de calcul: 11 noeuds, 88 coeurs, 464Go RAM
blast2_form fleche rocks_cluster
Services de MBB
Service cluster de MBB
  • Description
    • 10 noeuds de calcul réservés à un accès direct par SSH (80 coeurs, 378Go RAM)
    • 6To d'espace de stockage total partagé (NAS)
    • Un système de gestion des jobs : premier arrivé, premier servi
  • Contraintes/Limites
    • Un contrôle d'accès/SSH (adresse + utilisateur)
    • Des quotas
      • 70Go de stockage/utilisateur par défaut
      • Taille des fichiers de sortie de 16Go maximum
Services de MBB
Service Rstudio
Rstudio MBB
Services de MBB
Service "Big mem"
  • Pour projets spécifiques, gourmands (parallélisation, NGS, Big Data)
  • 1 machine actuellement : 500Go RAM, 64 coeurs,
    3To stockage local
R720 MBB
Services de MBB
Service GPU
  • Carte tesla K20 (2496 coeurs, 5GB GDDR5; jusqu'à plus de 10x plus rapide)
GPU MBB
Services de MBB
Service galaxy - en perspective
  • En service actuellement à l'ISEM
Galaxy MBB
Architecture de la plateforme
architecture MBB
Services développement logiciel


Référencement
Aide au développement


Intégration à la plateforme
Intégration à la plateforme
Intégration à la plateforme
Intégration à la plateforme






Paramétrage basique
d'un online tool

Intégration à la plateforme






Paramétrage plus complet
d'un online tool

Intégration à la plateforme






Résultat
d'un online tool

Aide au développement


Aide au développement logiciel




Développement logiciel :
Aide au développement logiciel




Aide au développement logiciel






Outils de versionnement
décentralisés (Git, Mercurial...)

Aide au développement logiciel






Gestionnaire
de projet
Redmine

Aide au développement logiciel






Gestionnaire
de projet
Redmine (Wiki)

Aide au développement logiciel






Gestionnaire
de projet
Redmine (Calendrier)

Aide au développement


Formations




Comment accéder aux services de MBB ?

http://mbb.univ-montp2.fr
mbb@mbb.univ-montp2.fr



70 outils en ligne interfacés
72 utilisateurs enregistrés
1 210 j/CPU pour les online tools

37 binaires et sources hébergés
3 342 visiteurs uniques du site
150 000 j/CPU pour les jobs SSH