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\usetheme{Montpellier}

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\title{Montpellier Bioinformatics Biodiversity Platform - MBB}
\author{Rémy Dernat}

\begin{document}



\frame
{
	\frametitle{Montpellier Bioinformatics Biodiversity Platform (MBB)}
	\includegraphics[scale=0.3]{../AG_ISEM/personnel_mbb.png}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Khalid Belkhir,
    \item<1-> Jimmy Lopez,
    \item<1-> Rémy Dernat.
  \end{itemize}
}

\frame
{
  \frametitle{MBB - services}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Du calcul (cluster, machines réservables : bigmems, GPU) avec possibilité de WebUI (rstudio, et WorkFlows bioinfos : galaxy, MBB Web),
    \item<1-> Du support (forges gitlab) / soutien / aide au développement.
  \end{itemize}
}

\frame
{
	\frametitle{Le service GPU}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Existe depuis 2014
    \item<1-> Gros renouvellement en septembre de cette année (CeMEB avec motivations \textbf{DeepLearning})
  \end{itemize}
}

\frame
{
  \frametitle{Détail des cartes}
  \begin{itemize}
    \item<1-> 2014 : 1 machine avec 1 Tesla K20m
    \item<1-> Septembre 2017 : 2 machines à base de cartes \textbf{TitanXp}
  \end{itemize}
}

\frame
{
  AbsolutePC / garantie 3 ans / Core \textbf{i7-6850k} 3.6GHz 6 coeurs / 128Go RAM / 2*SSD 265Go / 1 HDD 6To
  \begin{figure}[H]
  \centering
  \frametitle{Détail des machines}
  \includegraphics[scale=0.3]{nvidia-quad-titanxp-devbox-skylake-x.jpg}
  \end{figure}
}

\frame
{
  \begin{figure}[H]
  \centering
  \frametitle{Détail des cartes} 
  \href{http://www.tomshardware.fr/articles/test-titan-xp-nvidia-performance-benchmark,2-2681.html}{Pourquoi ce choix ?}
  \includegraphics[scale=0.2]{../MBI/titan_xp.jpg}
 	\end{figure}
}

\frame
{
	\frametitle{Détail des cartes}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Le service : 2014
    \begin{itemize}
      \item<1-> Architecture Kepler
      \item<1-> Une carte \color{red}{3.5 TFlops}, GPUs à 700MHz, bandwidth 208Go/s
      \item<1-> gpu28 [2496 Coeurs/5Go GDDR5]
    \end{itemize}
  \end{itemize}	
  \begin{itemize}
    \item<2-> Le service : 2017
    \begin{itemize}
      \item<2-> Architecture Pascal
      \item<2-> Par carte : \color{red}{12 TFlops}, GPUs à 1.582GHz, bandwidth 548Go/s
      \item<2-> abso1 [3840 Coeurs/12Go GDDR5X] *\textbf{4}
      \item<2-> abso2 [3840 Coeurs/12Go GDDR5X] *\textbf{3}
    \end{itemize}
  \end{itemize}
}

\frame
{
	\frametitle{Règles d'utilisation - généralités}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Réservation sur \url{http://mbb.univ-montp2.fr/grr} avec un ticket explicatif sur \url{http://kimura.univ-montp2.fr/calcul/helpdesk_NewTicket.html}
    \item<1-> Upload des données d'entrée par FTP sur disques SSD
    \item<1-> Ecriture des résultats sur disque HDD
    \item<1-> Récupération des résultats avant la fin de la réservation.
  \end{itemize}
}

\frame
{
	\frametitle{Règles d'utilisation - durée}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Durée/fréquence : 6 semaines renouvellable 1 fois sur une période de 4 mois.
    \item<1-> Nous adapterons cette règle en fonction du nombre de demandes.
  \end{itemize}
}

\frame
{
	\frametitle{Librairies}
  \begin{itemize}
    \item<1-> Cuda 8 et Cuda 9
    \item<1-> ...et ce que vous voulez (root dans le docker)
    \item<1-> conteneurs dockers \textbf{nvidia-docker}
    \begin{itemize} 
        \item<1-> SSH 
%%        \item<1-> \rotatebox{7}{nvidia DIGITS}
        \item<1-> nvidia DIGITS
    \end{itemize}
    \begin{figure}[H]
    \centering
    \includegraphics[width=0.2\textwidth,right]{NVIDIA-DIGITS-LOGO.png}    
    \end{figure}
  \end{itemize}
}

\frame
{
  \frametitle{Contacts}
  \begin{itemize}
    \item<1-> \url{http://kimura.univ-montp2.fr/calcul/helpdesk_NewTicket.html}
    \item<1-> mbb@mbb.univ-montp2.fr
  \end{itemize}
}

\end{document}
